蘆竹溝位於將軍溪出海口北岸，早年此地的溝渠眾多，溝上蘆竹仔多而得名，庄北蘆竹溝漁港是昔日台南縣3大漁港之一，今港已衰，漁船多為機器膠筏，是全縣最大的膠筏漁港。