三老爺宮開基於清康熙初葉，為明朝遺臣所建祠宇，祀朱王爺（鄭成功）。鄭氏軍隊由禾寮港德慶溪（原三老爺宮前）登岸，曾駐軍於此，圍攻赤崁樓，致使荷蘭人投降。鄭氏克台後，為反清復明，奔走國事，積勞成疾，來台一年即告圓寂。遺臣為崇仰且功德，乃塑造金身奉祀。

至康熙廿三年（西元一六八四年）清軍水師提督施琅將軍，征台入關，嗣子鄭克塽降清，里民為避隱清官面目，而將國姓爺改尊奉為朱王爺，繼續崇奉。乾隆十五年（西元一七五○年）境內三老爺街，安祿境街及鴨母寮街等里民合力捐建擴大廟宇延襲至今。民國卅三年中日戰爭，廟宇被炸損，加以年久未修，面目全非，於民國卅八年鳩資重建，而今日之廟貌，乃民國八十五年重建完成。